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阿里云智能達摩院-新G肺炎全基因組測序智能分析

來源:人工智能產業發展聯盟     編輯:創澤   時間:2020/6/11   主題:其他 [加盟]

抗疫期間所解決的業務需求

快速準確的診斷新G肺炎,并研究病毒基因組的演化,以便確定病毒的來源及傳播。

解決方案及特色

基因組檢測需要做到快速準確,對海量測序數據做到快速分析需要強大的計算和存儲系統。依托阿里云強大的云平臺,支持線上和本地化大數據套件部署。
基因組數據分析方面,主要提供并行、分布式的大數據分析系統。功能包括序列質控、序列比對、序列拼接。每個步驟經過優化設計和參數調優使得對于 CPU 和內存的利用更為G效,從而有效減少了數據分析的時間。此外,系統提供友好界面,并支持一鍵出分析報告功能。
除了病原體檢測之外,對于不同來源病原體的序列和結構分析有助于實現病原體的朔源和對應藥物分析。進化分析以及基于深度學習的人工智能算法能夠加速并且準確實現預期目的。
系統采用云架構,支持線上和用戶本地部署。配合阿里云專有云的 Iaas 和 Paas 系統,快速搭建大數據平臺。該平臺采用分布式存儲和分布式計算系統,有效解決基因測序數據量大,分析計算需要分布式或并行方式的特點。基于該大數據平臺,分析速度能有效提升 4~10 倍,人工智能分析處理速度也大幅提升。

應用與效果

全基因組測序技術在全國進行應用實踐。阿里達摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫院做試點應用,效果不錯,整體準確率非常G。

產學研結合情況及效果

在我們的實際應用中,該項技術整合了生物制藥企業、人工智能企業、醫療機構、G校等各方技術力量,從試劑研發、數據分析、流程設計等多角度全方位的設計來改進和完善技術。





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資料獲取
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